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核心公告
 
 
徵求CRISPR/Cas9 library篩選合作計畫
2016/03/11

C6核心已製備了一批全基因體CRISPR/Cas9偽慢病毒資源庫(人類:122,417 sgRNAs;老鼠:130,209 sgRNAs)。此批試劑將用以協助國內的研究學者進行全基因體人類或老鼠CRISPR相關篩選實驗。該批偽慢病毒試劑將不上架分讓,我們將免費提供給有意執行CRISPR/Cas9 library篩選合作計畫(for pooled screening only)的使用者進行研究。由使用者先建立適合的Cell-based assay篩選平台,並提出CRISPR/Cas9 library篩選合作計畫書(附件一);經由C6核心審核通過後,簽署合作研究計劃契約(附件二),方可執行。

依MOST規定,正式簽署的合作計劃,發表學術研究論文時需將C6核心(C6核心管理人為代表)列為共同作者之一。

請有興趣執行CRISPR/Cas9 library篩選合作計畫的老師盡早建立適合的篩選平台,盡早提出篩選合作計畫書申請,以免向隅。執行CRISPR/Cas9 library篩選計畫的Cell-based assay system需經過實驗驗證,且經由C6核心審核通過後,方可以提供CRISPR/Cas9偽慢病毒資源庫。篩選合作計畫中需寫明欲申請的全基因體CRISPR/Cas9偽慢病毒資源庫、篩選用細胞株名稱、預計篩選實驗所使用的病毒MOI(Multiplicity of infection)以及Representatives for each sgRNA、並計算所需要的病毒數量等資訊。病毒感染能力會因為使用的細胞株不同而不一樣,核心所提供的病毒效價為A549細胞株量測之結果,請務必在您所使用的細胞株中重新測定RIU (relative infection units)。

若有其他不清楚的地方,請洽詢C6核心聯絡人周祐吉:02-2789-8763分機16。

C6核心目前可提供的全基因體CRISPR/Cas9偽慢病毒資源庫產品編號如下:cat#1000000048、cat#1000000049、cat#1000000052、cat#1000000053、Pooled library #62217及Pooled library #60956 (上述CRISPR資源庫詳細內容請參考Addgene網站)。

參考文獻:
1. Improved lentiviral vectors and genome-wide libraries for CRISPR screening. Sanjana NE*, Shalem O*,Zhang F. Nature Methods (2014).

2. Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells. Shalem O*, Sanjana NE*, Hartenian E, Shi X, Scott DA, Mikkelsen T, Heckl D, Ebert BL, Root DE, Doench JG, Zhang F (2014). Science, 343, 83-7. DOI:10.1126/science.1247005.

3. Genome-Scale CRISPR-Mediated Control of Gene Repression and Activation. Gilbert LA, Horlbeck MA, Adamson B, Villalta JE, Chen Y, Whitehead EH, Guimaraes C, Panning B, Ploegh HL, Bassik MC, Qi LS, Kampmann M, Weissman JS. Cell. 2014 Oct 23;159(3):647-61. doi: 10.1016/j.cell.2014.09.029.

4. A protocol for pooled screening by using CRISPR library. doi:https://doi.org/10.1101/059626

合作研究計畫書表格如附件。此申請書請轉成PDF檔案格式email至 C6 Core 服務信箱(RNAiCore@gate.sinica.edu.tw)。

如有任何相關問題,歡迎與我們聯絡!!


2016/3/11
附件

 
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